명부전 뒤로 가면 방장선원으로 들어가는 작은 문이 나옵니다. 문을 들어서면 천은사를 흐르는 계류가 본당과 선원을 가로지르고 있고 그  위에 운수교가 놓여 있습니다. 이곳은 스님들이 반야의 보검을 가는 참선수행처이어서 일반인들은 일체 출입할 수 없는 곳입니다.
선원의 본체는 정면 7칸, 옆면 3칸의 맞배지붕입니다. 원래 이곳은 약사암이라는 작은 산내암자에 속했으나 근세들어 선원으로 사용하고 있습니다.큰방에는 오대산 상원사 문수동자상을 본 뜬 문수동자상이 모셔져 있습니다.